云南省中醫(yī)藥民族醫(yī)藥博物館是云南省唯一的省級傳統(tǒng)醫(yī)藥博物館，由云南中醫(yī)學院承建，坐落在昆明呈貢大學城云南中醫(yī)學院校園內(nèi)。博物館建筑格局是四合院的庭院式，整體外觀頗具傣族庭院風格，厚重而又不失飄逸，棱角分明卻也和諧相生。
博物館于2009年建設(shè)，前期部分建設(shè)經(jīng)費由香港友人伍達觀先生資助，后期建設(shè)經(jīng)費為云南省衛(wèi)生廳專項撥款。博物館于2010年十一月由云南省文物局正式批復成立，總建筑面積4651.59m2，有12個展室，每個展室約220m2。展區(qū)部分共3層，每層4個展室：第一層，院史展室2個、中醫(yī)西傳展室1個、中醫(yī)藥文化展室1個;第二層為民族醫(yī)藥展室，分為云南民族醫(yī)藥文化、云南民族醫(yī)藥診治特色、云南民族藥開發(fā)成果和云南民族藥標本展室各1個;第三層為中藥標本展室，分為《滇南本草》、《神農(nóng)本草經(jīng)》、云南特色藥物、傳統(tǒng)藥材等標本展室各1個?，F(xiàn)已建設(shè)完成7個展室即中藥標本展室4個、院史展室2個和云南民族藥標本展室1個，已免費對外開放;其他展室正在建設(shè)當中，2012年將完成博物館所有展室的建設(shè)，并對外開放。
博物館以云南地產(chǎn)中藥資源和民族醫(yī)藥資源為館藏特色，旨在弘揚中醫(yī)藥和民族醫(yī)藥文化，展示中醫(yī)藥的系統(tǒng)科學性和民族醫(yī)藥的獨創(chuàng)性。博物館現(xiàn)有民族藥標本400多種，中藥標本2000多種(其中浸泡標本170種、飲片標本460種)，古籍50余冊，中醫(yī)藥、民族醫(yī)藥文物、實物等100多件。
博物館于2012年成功申報為云南省中醫(yī)藥文化宣傳教育建設(shè)基地，2012年正式掛牌為云南省科學教育普及基地。博物館自建設(shè)以來已接待國內(nèi)外各界人士數(shù)千人，開展科普活動多次，成為弘揚云南傳統(tǒng)醫(yī)藥文化的窗口以及中醫(yī)藥、民族醫(yī)藥愛好者和科研工作者交流、學習的平臺。