重慶五里坡國家級自然保護區(qū)位于巫山縣東北部，地處重慶市與湖北省交界處，東、西、北面分別與湖北省巴東縣、神農(nóng)架林區(qū)、重慶市巫溪縣相接，和重慶陰條嶺國家級自然保護區(qū)、湖北神農(nóng)架國家級自然保護區(qū)、大九湖國家級濕地公園毗鄰，地理位置在東經(jīng)109°47′～110°10′，北緯31°15′～31°29′之間，范圍涉及2個林場、5個鄉(xiāng)鎮(zhèn)21個村，總面積35276.6公頃，其中：核心區(qū)面積17323.1公頃，緩沖區(qū)面積6555.8公頃，實驗區(qū)面積11397.7公頃。屬森林生態(tài)類型的自然保護區(qū)。
保護區(qū)位于大巴山弧和川東褶皺帶的結(jié)合部，大多為低山和中山地形，喀斯特地貌分布廣泛。最低海拔僅170米，最高海拔達2680米，地表破碎，高差懸殊。保護區(qū)屬亞熱帶季風性濕潤氣候，全年平均溫度高于10℃的日數(shù)為225天左右，年降水量約1400毫米，其中55%～60%的降水集中在夏季，雨季明顯。保護區(qū)土壤類型主要為山地黃壤、山地棕黃壤和山地棕壤。此外還零星分布有潮土、紫色土和灰化土。保護區(qū)地表水源極為豐富，徑流總量為1.5億立方米，有當陽河、廟堂河2條主要河流，另有眾多溪流遍布其中，均屬長江水系。保護區(qū)有7種植被類型（寒溫性針葉林、溫性針葉林、暖性針葉林、闊葉林、竹林、灌叢、灌草叢），59個群系；有維管植物196科894屬2646種。根據(jù)1999年國家林業(yè)局公布的《國家重點保護野生植物名錄（第一批）》，保護區(qū)有國家重點保護野生植物19種（其中Ⅰ級4種，Ⅱ級15種）。保護區(qū)有陸生脊椎動物29目94科252屬422種，魚類7目16科72屬113種，昆蟲12目73科209屬258種，根據(jù)1989年國家林業(yè)部公布的《國家重點保護野生動物名錄》，保護區(qū)有國家重點保護野生動物55種（其中Ⅰ級8種，Ⅱ級47種）。
保護區(qū)始建于2000年。為充分發(fā)揮五里坡林區(qū)涵養(yǎng)水源、維持生態(tài)平衡的作用，保護當?shù)匾吧鷦又参镔Y源, 2000年9月，巫山縣人民政府在天然植被保存完好、自然資源豐富、野生動植物集中分布的巫山縣東北部地區(qū)劃定了五里坡自然保護區(qū)。2002年12月，重慶市人民政府批準建立巫山五里坡市級自然保護區(qū)。2003年12月，巫山縣五里坡林場增掛巫山縣五里坡市級自然保護區(qū)管理處牌子，實行一個機構(gòu)，兩塊牌子的管理體制。2007年，巫山縣五里坡林場更名為重慶五里坡市級自然保護區(qū)管理處，同時撤銷原增掛的巫山縣五里坡市級自然保護區(qū)管理處牌子。2013年6月，國務院批準五里坡保護區(qū)晉升為國家級自然保護區(qū)。2013年11月，巫山縣編委會批準成立重慶五里坡國家級自然保護區(qū)管理局，為正科級事業(yè)單位。