馬橋古文化遺址(MaqiaoGuwenhuaYizhi)位于閔行區(qū)馬橋鎮(zhèn)北竹港和俞塘匯合處西北側(cè)。面積約5000平方米。1959年發(fā)現(xiàn)，1960年、1966年兩次發(fā)掘。出土石、玉、陶、骨、銅器等文物500余件，是太湖地區(qū)早期印紋陶文化的典型遺存。1982年定名為“馬橋文化”。遺址的發(fā)現(xiàn)證明了4000多年前這里已有先民生息，為研究上海史和中國東南地區(qū)古文化、南北文化的相互關(guān)系和影響提供了實(shí)物材料和科學(xué)依據(jù)。1977年被列為市級(jí)保護(hù)地點(diǎn)。
馬橋遺址是迄今已知最大的含馬橋文化內(nèi)涵的遺址，1993－1997年的發(fā)掘獲得了豐富的資料。本項(xiàng)研究系統(tǒng)、完整地整理、發(fā)表了這批資料，其中包括新石器時(shí)代良渚文化遺存、夏商時(shí)期馬橋文化遺存和春秋戰(zhàn)國至宋元時(shí)期遺存，以馬橋文化遺存最為豐富。出土了各時(shí)期的陶瓷器、石器、骨角器、青銅器等，還出土了大量的動(dòng)物遺骸，并且通過采樣分析獲取了其他的自然遺存。對(duì)發(fā)掘出土的文化遺存和自然遺存從不同角度作了深入細(xì)致的考古學(xué)、微體古生物學(xué)、動(dòng)物學(xué)、植物學(xué)、硅酸鹽等多學(xué)科研究，另外還對(duì)良渚文化和馬橋文化墓葬人骨作了DNA分析。對(duì)馬橋遺址和馬橋文化全面深入的研究，其成果是迄今為止最翔實(shí)的馬橋文化遺址發(fā)掘和研究報(bào)告，完整地公布了所發(fā)現(xiàn)的文化遺存和自然遺存，發(fā)表了最新的研究成果。馬橋發(fā)掘報(bào)告不僅能使學(xué)術(shù)界能夠比較全面地認(rèn)識(shí)馬橋文化，推動(dòng)環(huán)太湖地區(qū)古代文化研究的深入，而且還有利于夏商時(shí)期中原與周邊地區(qū)文化比較研究工作的開展，對(duì)探討長(zhǎng)江流域文明化進(jìn)程具有重要的意義。
2013年5月，被國務(wù)院核定公布為第七批全國重點(diǎn)文物保護(hù)單位。