清心堂位于黃浦區(qū)大昌街30號的清心堂，原名“上海長老會(huì)第一會(huì)堂”，成立于清咸豐十年（1860年）。不久，美國差會(huì)開辦清心書院（原址在今陸家浜路597號），該堂做禮拜就在書院內(nèi)，故又稱“清心堂”。信徒大多是書院的教職員工、家屬和學(xué)生。清心堂初創(chuàng)階段，堂牧由清心書院院長范約翰兼任。1919年，清心堂從清心學(xué)校遷出，擇地建造新堂（即今址），1923年落成。新堂的禮堂建筑平面呈獨(dú)特的“人”字形。清心堂曾辦有清心中學(xué)（今上海市市南中學(xué)）、清心女子中學(xué)（今上海市第八中學(xué)）、圣經(jīng)學(xué)院和普益社。
1958年，清心堂成為南市區(qū)聯(lián)合禮拜場所。1979年9月9日，舉行復(fù)堂禮拜。清心堂地處南市老城廂，信徒以勞動(dòng)人民為主。1992年，該堂進(jìn)行大修，同時(shí)新建二層樓小禮堂。1994年3月，清心堂被列為上海市建筑保護(hù)單位。
1860年3月（咸豐十年），范約翰和妻子范瑪利從美國到達(dá)上海，在大南門外陸家浜創(chuàng)辦上海長老會(huì)第一會(huì)堂（清心堂的前身）和清心男塾（LowrieInstitute，譯名婁離華學(xué)堂，今上海市市南中學(xué)），次年又創(chuàng)辦清心女塾（theMaryFarnhamGirls'School，今上海市第八中學(xué)）。教堂長期設(shè)在清心書院內(nèi)的思鮑堂，信徒也大多是清心書院的師生，這些學(xué)生多是太平天國戰(zhàn)亂避難來滬的難民兒童。1919年由李恒春牧師發(fā)起在附近的大佛廠街（今大昌街30號）建造清心堂，禮拜堂才從學(xué)校遷出，1923年元旦落成開堂，使用至今。教堂建筑平面呈獨(dú)特的“人”字形，圣堂樓下，自正門至圣臺間距離較短，而兩翼呈直角又如扇形向左右延伸較長，早期為男女分開做禮拜。樓上樓下無一根柱子，平頂高懸，地面自邊門至圣臺略呈波形，在建筑上頗具特色。
據(jù)2005年11月16日《新民晚報(bào)》報(bào)道，著名物理學(xué)家李政道、剛剛故去的著名漫畫家丁聰、商務(wù)印書館的創(chuàng)始人夏瑞芳、鮑咸恩、鮑咸昌和高鳳池都畢業(yè)于清心中學(xué)。夏瑞芳、高鳳池和鮑氏兄弟在清心中學(xué)就讀時(shí)已是好友，1897年2月他們在上海江西路德昌里創(chuàng)辦了商務(wù)印書館，英文名字“CommercialPress”，商標(biāo)就是英文字母C和P中間一個(gè)“商”字，可以說商務(wù)印書館是從清心中學(xué)里“出來”的。上海的閘北堂也與北長老會(huì)和商務(wù)印書館有較深的血脈淵源，后文再敘。
清心女校也給后世留下不少掌故，其中一條很有意思。2008年2月1日《文匯報(bào)》的一篇回憶短文中，提到當(dāng)年的清心女校對聘請教師規(guī)定很嚴(yán)，一定要是基督徒，而且是不結(jié)婚的，一旦結(jié)了婚，就要辭退。令人感興趣的是，這種將“賢妻良母”與職業(yè)分離的選擇，為何竟然出自受西方影響最深的女校？
2014年4月4日，上海市人民政府核定并公布清心堂為上海市文物保護(hù)單位（滬府發(fā)〔２０１４〕２９號）。